Występuje istotna różnica w porównaniu z chemią, gdzie procesy produkcyjne przebiegają przy wysokich ciśnieniach i temperaturach, dlatego są bardzo intensywne energetycznie i często wykluczają użycie kwasów lub rozpuszczalników. Ponieważ szybkości przemiany materiałów przez mikroorganizmy są stosunkowe małe, musi być zapewnione odpowiednie otoczenie, aby umożliwić optymalną wymianę materiałów. Bardzo specyficzne warunki występują częściowo w bioreaktorach (fermentorach), które mogą pracować nieciągle lub ciągle.
Mieszanka gazowa dla fermentora
Biotechnologia pracuje z mikroorganizmami, jak bakterie, drożdże lub grzyby, co umożliwia przebieg procesu przy normalnych ciśnieniach i temperaturach i w środowisku wodnym.